Las Eliminatorias para el Mundial de 2002 en Japón y Corea del Sur, instalada ya la modalidad de competencia sudamericana, pusieron en evidencia la debilidad que nuestra selección había mostrado en la clasificación para Francia 98. En este torneo se produjo la etapa final de la generación del 93 y se ensayó el recambio, cuyos resultados no fueron los esperados.

De hecho Bolivia se topó con la dura realidad, su fútbol estaba estancado desde 1997, al contrario de lo que pasaba en otras selecciones de la región, particularmente Ecuador. 

Las Eliminatorias para el Mundial de 2014 en Brasil marcaron el punto más bajo desde que comenzó la modalidad de todos contra todos. Aunque por gol diferencia no ocupó el último lugar (cosa que sí ocurrió en las Eliminatorias para el Mundial de Alemania 2006), sólo sumó 12 puntos, el peor número de unidades de todo el periodo iniciado en 1996 en las eliminatorias para Francia 98. La selección llegó al fondo del pozo.

Para el Mundial de 1998 en Francia se abrió una nueva etapa histórica que modificó radicalmente la modalidad de las Eliminatorias de América del Sur. Lo que hasta el Mundial de Estados Unidos había sido un sistema de clasificación por series, pasó a ser de hecho un campeonato de todos contra todos entre los diez países del continente, salvo aquellas versiones en las que alguna de las selecciones había obtenido el cetro mundial en el torneo anterior o sería sede en el torneo próximo.